Moi j'vote 1 !
Défragmenter ? C'est pas un Scan ?! Bon... ok.
Laisse le défragmenter une fois pour toute, laisse le log à la racine de ton DD externe et redémarre.
Sinon, évite de l'allumer PENDANT le démarrage, fais le avant ou après.
Le problème peut aussi venir du fait que Windows ne se ferme pas normalement alors il teste tous les disques pour voir si le problème ne vient pas de là.
Peux pas faire plus clair ! Lol